MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 7893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020992	AAATA	2	10	18	27	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020992	AAC	2	6	46	51	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020992	ATA	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020992	TAAT	2	8	1932	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020992	A	6	6	1977	1982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020992	T	6	6	2050	2055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020992	A	6	6	3536	3541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020992	ATT	2	6	3677	3682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020992	A	6	6	4904	4909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020992	TA	3	6	4938	4943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020992	TAG	2	6	5006	5011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020992	TAT	2	6	5104	5109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020992	AT	3	6	5845	5850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020992	A	6	6	5855	5860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020992	ATA	2	6	5880	5885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020992	AGA	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020992	A	6	6	5903	5908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020992	T	7	7	5918	5924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020992	A	6	6	5939	5944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020992	TAT	2	6	5999	6004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020992	TAA	2	6	6749	6754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020992	AT	3	6	6817	6822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020992	TATT	2	8	8988	8995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020992	ATCTT	2	10	9023	9032	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020992	TA	3	6	9102	9107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020992	TTGT	2	8	9114	9121	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020992	TA	3	6	9178	9183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020992	TCA	2	6	9184	9189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020992	TTTC	2	8	11020	11027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020992	TATACA	2	12	11032	11043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020992	ATT	2	6	11048	11053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020992	TTATA	2	10	11554	11563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020992	TA	4	8	11560	11567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020992	AATGA	2	10	11596	11605	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020992	TTA	2	6	12462	12467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020992	ACT	2	6	14205	14210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020992	TTA	2	6	14239	14244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020992	TA	3	6	14243	14248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020992	TAA	2	6	14265	14270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020992	ATT	2	6	14314	14319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020992	AT	3	6	14375	14380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020992	ACT	2	6	14381	14386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020992	T	7	7	14467	14473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020992	TTCT	2	8	14497	14504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020992	ATT	2	6	14569	14574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020992	TTAT	2	8	14584	14591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020992	TAT	2	6	14604	14609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020992	TTTA	2	8	14642	14649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020992	ATT	2	6	14715	14720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020992	A	7	7	14782	14788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020992	GTA	2	6	14828	14833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020992	ATT	2	6	14873	14878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020992	TAAT	2	8	14888	14895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020992	ACAATA	2	12	14916	14927	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020992	TTC	2	6	14964	14969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020992	CATT	2	8	19191	19198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020992	ACA	2	6	19232	19237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020992	ACA	2	6	19251	19256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020992	TA	3	6	19257	19262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020992	TAA	2	6	23453	23458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020992	T	7	7	23500	23506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020992	TAATA	2	10	23561	23570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020992	TA	3	6	23599	23604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020992	ATT	2	6	23613	23618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020992	GATA	2	8	23647	23654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020992	TAA	2	6	23684	23689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020992	T	6	6	23708	23713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020992	GTT	2	6	23759	23764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020992	A	6	6	23780	23785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020992	GATTT	2	10	23786	23795	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020992	T	6	6	23809	23814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020992	TAA	2	6	23864	23869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020992	ATT	3	9	23899	23907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020992	AAT	2	6	23949	23954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020992	AAT	2	6	23971	23976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020992	TAAA	2	8	23980	23987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020992	A	6	6	23985	23990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020992	AAG	2	6	24035	24040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020992	A	6	6	24072	24077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020992	AAAG	2	8	24092	24099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020992	TTTAA	2	10	24100	24109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020992	TAA	2	6	24113	24118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020992	ACT	2	6	24152	24157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020992	CAA	2	6	24159	24164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020992	ATT	2	6	24169	24174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020992	ATAA	2	8	24201	24208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020992	T	9	9	24634	24642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020992	ATTA	2	8	24674	24681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020992	TAC	2	6	24692	24697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020992	T	6	6	24709	24714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020992	A	7	7	24715	24721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020992	AAT	2	6	24723	24728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020992	A	6	6	24737	24742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020992	ATT	2	6	24774	24779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020992	CTT	2	6	25333	25338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020992	T	6	6	25348	25353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020992	TAA	2	6	26594	26599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020992	AAG	2	6	26628	26633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020992	TTTA	2	8	26669	26676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020992	TTA	2	6	26682	26687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020992	AAT	2	6	27543	27548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020992	TA	3	6	27569	27574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020992	TA	4	8	27589	27596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020992	CT	3	6	27613	27618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020992	TAA	3	9	27721	27729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020992	TAT	2	6	27750	27755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020992	ATTA	2	8	27822	27829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020992	TCT	2	6	27830	27835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020992	T	6	6	30451	30456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020992	CT	3	6	30457	30462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020992	CTAA	2	8	30467	30474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020992	A	6	6	30872	30877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020992	A	6	6	30884	30889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020992	CTTA	2	8	30890	30897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020992	CT	3	6	30937	30942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020992	ATT	2	6	31003	31008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020992	ATT	2	6	31691	31696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020992	AT	3	6	31697	31702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020992	T	6	6	31702	31707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020992	GCA	2	6	31730	31735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020992	A	6	6	31739	31744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020992	TTG	2	6	31761	31766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020992	ATAA	2	8	31781	31788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020992	AAT	2	6	31789	31794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020992	TA	3	6	31797	31802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020992	AATT	2	8	33601	33608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020992	T	6	6	33607	33612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020992	ACTTA	2	10	33641	33650	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_020992	ATT	2	6	33656	33661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020992	AAT	2	6	33678	33683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020992	CTG	2	6	33713	33718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020992	ATT	2	6	34151	34156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020992	TTA	2	6	34161	34166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020992	ATTTC	2	10	34177	34186	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020992	A	6	6	34219	34224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020992	ATA	2	6	34660	34665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020992	A	6	6	34706	34711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020992	ATT	2	6	34728	34733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020992	ATG	2	6	34768	34773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020992	TTTAA	3	15	35527	35541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020992	GCTTA	2	10	35552	35561	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_020992	AAGT	2	8	35603	35610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020992	GAC	2	6	37184	37189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_020992	TTA	2	6	38071	38076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020992	A	6	6	38094	38099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020992	AAG	2	6	38107	38112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020992	ATG	2	6	38162	38167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020992	GTA	2	6	38176	38181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020992	AT	3	6	38192	38197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020992	T	6	6	39243	39248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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